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Data Analyst en génomique – Programme ACCES AP-HP F/H. Au sein de l’équipe Analyse et Usage des Données, vous rejoignez un environnement stimulant où la donnée est au cœur de l’innovation et la recherche en santé. Votre mission consiste à analyser, structurer et valoriser les données de santé afin d’en garantir l’exploitabilité, au service de projets à fort impact scientifique et médical. Vous jouez un rôle clé dans la qualification, l’intégration et la valorisation des données génétiques et génomiques issues des plateformes de séquençage, au service de la recherche, de l’innovation et de l’appui au soin. Ces données, à très forte valeur ajoutée, sont particulièrement attendues par la communauté médicale et constitueront le socle d’une nouvelle offre de service.
Responsabilités
Analyser et évaluer la qualité des données génétiques et génomiques issues des logiciels de soin et de recherche
Qualifier, normaliser, tracer et structurer les données en vue de leur intégration et de leur réutilisation
Définir les besoins de transformation, d’enrichissement et d’annotation pour répondre aux usages de recherche, de pilotage et d’appui au soin
Mettre en place des plans de tests et des contrôles qualité adaptés
Accompagner les utilisateurs dans la compréhension et l’usage des données, en lien avec les contextes cliniques et scientifiques
Documenter les données ainsi que leur cycle de vie au sein des outils de documentation et du catalogue de métadonnées de l’EDS
Contribuer à la mise en œuvre des bonnes pratiques de gouvernance, dans le respect des exigences réglementaires, éthiques et de sécurité
Exigences
Diplôme : ingénieur ou Master 2 en sciences de l'informatique, sciences des données, bioinformatique ou statistiques avec une première expérience dans le domaine médical, en lien avec la génomique
Niveau d’étude : Bac+5
Niveau d’expérience : 3 à 5 ans d’expérience
Bonnes connaissances en santé, épidémiologie, médecine, génétique et génomique humaine
Bonnes connaissances en modules bioinformatiques d’analyse et d’interprétation de données de séquençage
Bonnes connaissances des langages d’analyse de données : Python, R, SQL
Connaissances des outils de visualisation de données (Exemples : Shiny, Streamlit, Altair, Bokeh, …)
Connaissances des frameworks de tests sur données (Great Expectations, Pandera, DBT, …)
Connaissances en bases de données et des technologies du Big Data (NoSQL, SQL, Hadoop, S3, …)
Compréhension des scripts d’automatisation et des pipelines de données
Déontologie, Respect du secret professionnel
Expérience dans le domaine de la donnée, dans le domaine médical en lien avec la génomique
Maîtrise de l’anglais indispensable (écrit et oral)
Bonne capacité d’analyse et d’écoute
Sens du relationnel, pédagogie et qualités de communicant
Capacité d’adaptation
Force de proposition
Gestion du temps et des priorités
Ce que nous offrons
Possibilité de télétravail
Remboursement partiel des transports en commun ou forfait mobilité
Accès au restaurant du personnel à tarifs avantageux
Un centre formation et de développement des compétences interne pour les formations management, les renforcement Métiers…
19 jours de RTT, en plus des 25 jours de congés
Une offre de sorties culturelles, de voyages, de centres de vacances pour les titulaires et CDD sur poste permanent (AGOSPAP), des réductions et des bons plans (HOPTISOINS)
Pour les enfants, crèches internes, voyages culturels, séjours linguistiques et possibilité de bénéficier du supplément familial de traitement
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