Concepteur/Développeur informatique bioinformatique

• Conception, développement et évolution de pipelines d'analyse bioinformatique
• Intégration, automatisation et orchestration d'outils de traitement de données génomiques et transcriptomiques
• Mise en oeuvre et évaluation de nouvelles méthodes d'analyse de variants génétiques et de données omiques
• Exploitation et interprétation technique de données issues de technologies variées
• Structuration, fiabilisation et reproductibilité des traitements informatiques
• Développement de scripts, modules et outils facilitant le contrôle qualité, le post-traitement, l'agrégation et la restitution de résultats
• Documentation technique des développements réalisés
• Veille technologique et méthodologique sur les outils et approches d'analyse en bioinformatique
• Participation aux échanges avec les utilisateurs / biologistes / bioinformaticiens pour adapter les développements aux besoins des projets

• Bon niveau en programmation, en particulier Python
• Connaissance de l'environnement Linux / shell
• Intérêt pour l'automatisation de traitements et les workflows
• Appétence pour la gestion de données volumineuses
• Intérêt pour la bioinformatique, la génomique et l'exploitation de données cliniques et biologiques
• Connaissance d'outils ou concepts de type Git, Docker/containers, workflow managers, formats de données de séquençage constitue un plus
• Rigueur et sens de l'organisation
• Capacité d'analyse et de résolution de problèmes
• Goût pour le développement et l'amélioration continue
• Capacité à documenter son travail
• Anglais niveau professionnel
• Aptitude à travailler en équipe pluridisciplinaire

Connaissance d'outils ou concepts de type Git, Docker/containers, workflow managers, formats de données de séquençage